Boltz-1
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Boltz 1
簡介 :
Boltz-1是由麻省理工學院(MIT)阿卜杜拉·拉蒂夫·賈米爾健康機器學習診所(MIT Jameel Clinic)的研究人員開發的首個真正開源的生物分子結構預測模型,其準確性達到了AlphaFold3的水平。該模型以玻爾茲曼分佈命名,是一種描述分子結構分佈的概率度量。Boltz-1的開發旨在鼓勵超越學術界的創新,為商業用途提供支持。它由博士生Jeremy Wohlwend、Gabriele Corso和MIT Jameel Clinic研究員Saro Passaro領導開發,得到了MIT電氣工程和計算機科學(EECS)教授Regina Barzilay和Tommi Jaakkola的指導。Boltz-1的開發面臨了規模和數據處理的挑戰,但最終成功構建了必要的計算能力,為結構生物學研究實踐的標準化提供了基礎,有望加速生命改變藥物的創造。
需求人群 :
Boltz-1的目標受眾是全球的科研人員、生物技術公司和製藥企業。它特別適合那些需要精確預測蛋白質結構以推進藥物發現和基礎生物學研究的科研工作者。由於其開源特性,Boltz-1也適合那些希望在現有模型基礎上進行創新和改進的開發者。
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使用場景
科研人員使用Boltz-1預測蛋白質結構,以加速新藥的發現。
生物技術公司利用Boltz-1進行蛋白質設計,開發新型生物製劑。
教育機構使用Boltz-1作為教學工具,幫助學生理解蛋白質結構和功能。
產品特色
• 達到AlphaFold3級別的準確性:Boltz-1能夠提供與AlphaFold3相當的預測精度,為科學研究和商業應用提供了強大的工具。
• 完全開源:Boltz-1完全開源,允許全球科研人員自由使用和改進模型。
• 促進創新:模型的開源性質鼓勵了學術界和商業界的創新應用。
• 數據處理能力:Boltz-1能夠處理複雜的結構數據庫,如PDB(蛋白質數據銀行),並適應模型訓練。
• 計算能力需求:通過與美國能源部和Genesis Therapeutics的合作,Boltz-1獲得了運行所需的大量GPU資源。
• 標準化研究實踐:Boltz-1旨在幫助全球科學界標準化結構生物學的研究實踐。
• 促進新藥發現:Boltz-1的應用將加速新藥的發現和開發過程。
使用教程
1. 訪問Boltz-1的GitHub倉庫(https://github.com/jwohlwend/boltz)並克隆或下載代碼。
2. 閱讀文檔,瞭解Boltz-1的安裝和配置要求。
3. 根據指南安裝必要的依賴,並配置運行環境。
4. 運行Boltz-1模型,輸入蛋白質序列數據,開始結構預測。
5. 分析Boltz-1提供的預測結果,並根據需要調整參數以優化預測準確性。
6. 參與Boltz-1的社區討論,通過Slack頻道(https://boltz-community.slack.com/join/shared_invite/zt-2uexwkemv-Tqt9E747hVkE0VOWlgOcIw#/shared-invite/email)與其他用戶交流經驗和問題。
7. 根據需要對Boltz-1進行定製和擴展,為特定的研究或應用開發新的功能。
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